东方科软-BIOVIA_Discovery Studio软件使用常见Q&A
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东方科软-BIOVIA_Discovery Studio软件使用常见Q&A
飞书用户4307
飞书用户16532022年11月15日创建
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〇：前言
0.1 关于我们公司
东方科软（北京）科技有限公司成立于2016年，主要服务于材料科学与生命科学两大领域，为用户提供世界领先的模拟仿真软件、技术咨询及技术支持服务。公司打造行业领域产品生态圈，不断引进国内外先进产品与技术，为材料和药物的设计与创新提供综合解决方案。技术一流、服务一流，是公司孜孜不倦的追求。公司拥有一支专业的技术服务团队和资深的专家咨询团队，能为用户提供专业、高效、快捷、精准的技术支持与服务。针对药企和大学科研用户，公司立足Discovery Studio软件功能，从实际需求出发，不断开发新的Protocol，为用户解决关键问题。公司现已服务上百家用户，拥有丰富的项目和软件使用经验，相信未来公司也会伴您左右，成为值得您信赖和依赖的合作伙伴。
0.2 关于Discovery Studio软件
Discovery Studio是一款生命科学分子模拟软件，由Accelrys(现已被达索收购,更名为BIOVIA)公司开发。它将超过30 年的同行评议研究和世界一流的计算机模拟技术(如蛋白建模、分子力学、自由能计算、生物治疗药物可开发性等)整合到一个共同的软件平台中。它为研究人员提供了一个完整的工具集,用于探索蛋白质化学的细微差别并促进小分子和大分子治疗药物的发现,帮助研究人员在抗体开发过程中扮演重要角色。如下面问题所述，Discovery Studio Client（收费，需购买正版版权）分为Discovery Studio Visualizer（免费，引用即可）两种方式。下面提供的表格详细阐述了二者的功能差异。
0.3 关于DS文章版权
DS是达索系统开发的软件，以客户端连通服务端的形式实现功能，其中客户端是免费的，随着每个版本更新；服务端是收费的，需要license激活。因此所有使用客户端完成的功能无需版权。未连通的客户端左上角为Discovery Studio Visualizer、右下角为Enable Additional Features，且功能不全（一般可用来可视化）；已连通服务器的客户端左上角为Discovery Studio Client、右下角为服务器地址，功能齐全（一般用来计算+可视化）。
另外，对于文章来说，应当为主要作者（一二作及通讯作者）具有DS版权，七八作挂名并不可行，会被达索公司法务部追责。
0.4 关于DS软件在文章的引用
推荐引用格式如下：Ref. Dassault Systèmes BIOVIA, Discovery Studio Modeling Environment, Release [version], San Diego: Dassault Systèmes, [year of publication]. 以DS2023为例：Ref. Dassault Systèmes BIOVIA, Discovery Studio Modeling Environment, Release 2023, San Diego: Dassault Systèmes, 2023.
也可如：Discovery Studio Visualizer (version 2023, Dassault Systèmes, San Diego, USA)这种类似的，只要标明【软件名称，版本，厂商，地点】即可。
0.5 软件安装及软件激活
盗版安装问题不予提供解决方案，本公司代理正版Discovery Studio软件，如需购买请移步官网（https://www.imatsoft.com/），购买软件提供免费安装，免费培训，免费售后答疑等服务。
0.6 软件License过期
不存在这个问题，凡是在我司【东方科软（北京）科技有限公司】购买的正版DS软件都有会专人负责维护。因为DS软件License具有时效性，过期需要重新申请License和更换，本正版软件或其他途径购买软件，本公司不予提供免费的解决方案和相关服务。
0.7 如何将DS运行的问题文件发送至技术邮箱？
A：选择对应Job，鼠标右键选择Locate，此时会定位到DS运行结果的文件夹的output文件夹下，选择这个job的总文件夹，鼠标右键选择copy，然后至桌面，粘贴并压缩，发送到我们的DS技术邮箱：support_ls@imatsoft.com.(Properties可以看到在电脑中的具体位置等属性)
建议：最好使用单位邮箱。
0.8 QQ/微信群专供：为什么群里面发消息管理员不回复？
A：群消息三不回：
i.
不是真名不回；
ii.
备注不完整的不回；
iii.
没有按照姓名-单位-方向备注的不回；
一：蛋白大分子
涉及如核酸/多肽构建、序列分析建树、创建模型、改造蛋白、对接复合物等生物大分子相关问题。
1.1 构建核酸/多肽结构
Q：请问一下已知小肽氨基酸序列（8-15肽）怎么构建结构得到pdb呀？只有肽氨基酸序列，通过什么工具可以转化为3d结构呢